Q&A 常见问题及解答
这里收集用户的在集群使用过程中的典型问题并进行相关解答。
用户在集群使用过程中出现任何问题，欢迎到hpcde/cluster-docs: issues页面提交issue，或者邮件向管理员反馈：汪岸或储根深。
如果你有意愿想向该文档贡献内容,请fork该项目 https://github.com/hpcde/cluster-docs ,完成后pull request。
用户账户
Q: 为什么我能登录集群却不能使用计算节点？
A: 计算资源的使用权限由SLURM管理（sacctmgr），如果权限没有正确添加，请联系管理员。
Q: 我如何修改密码？
A: 在登录节点使用命令yppasswd。如果无法正常修改密码，或修改密码后提交作业失败、无法连接计算节点，请联系管理员。集群目前使用NIS管理Linux用户账户，使用普通的passwd修改密码后不一定会及时更新NIS信息。
存储资源
Q: 磁盘空间不够怎么办？
A: 文件应该尽可能放在$HOME/data/中，该目录中的数据存放在集群的存储节点上，空间较大。
Q: 为什么我的data目录不见了/无法使用？
A: $HOME/data只是/data/$USER/的一个软链接，如果它无法使用，可以自己建立新的软链接。
$ ln -s `/data/$USER` `$HOME/data`
Q: 可以在集群上与其他人共享文件吗？
A: 可以，拷贝到/tmp/目录中就能让所有用户访问。该目录中的文件可能会被清理(如系统重启)，因此要及时保存到自己的$HOME/data/中。
计算资源
Q: 为什么我无法运行mpirun？
A: 登录节点不允许执行mpirun，计算节点无法使用mpirun时请联系管理员。
Q: 在登录节点编译程序太慢该怎么办？
A: 同时有多个用户在登录节点上编译时，会影响其他用户。为了避免占用登录节点的资源，应该使用salloc申请一个计算节点，在计算节点上编译。
Q: 为什么我提交的作业一直在排队？
A: 可能是目前没有节点可用。使用squeue可以查看作业排队的原因，使用sinfo可以查看当前可用的节点。提交作业时要注意节点分区的名字，如果提交的分区没有节点可用，作业也不会运行。
Q: 为什么我没有权限ssh到计算节点？
A: 可能是因为没有申请资源。集群计算节点使用PAM，只有申请了计算资源才可以ssh到相应节点。
Q: 为什么sbatch提交的作业总是找不到需要的库？
A: 可能因为没有正确设置环境变量。在登录节点编译时，如果使用spack load或module load加载了某些软件包，同样也要在sbatch提交的脚本中写上加载软件包的命令。
Q: 为什么我的程序遇到mpiio就会卡死？
A: 请尝试把可执行文件、数据文件全部放在$HOME/data/下再执行。
软件使用
Q: 我可以使用自己安装的软件吗？
A: 可以，任何安装在$HOME/或$HOME/data/下的软件都可以在所有计算节点上使用。如果想通过spack load或module load使用自己安装的软件，请参考集群文档中Spack和Lmod的说明。
Q: 如何让其他人使用我安装的软件？
A: 共享同一个账户，或者联系管理员更新公共软件。在自己的路径下安装的软件是不能直接让其他人使用的。如果需要频繁安装、更新软件，可以让大家使用同一个账户（让管理员新开一个账户专门给小组用）。如果需要的软件不会频繁更新，可以联系管理员安装，所有的公共软件都由builder账户在特定节点安装。
Q: 如何安装新的Python包？
A: 如果使用集群上的Lmod加载Anaconda3，可以创建自己的conda环境，使用conda命令安装Python包。如果使用集群上的pip，可以安装Python包到本地。
$ pip install --user <package name>
如果希望通过Spack加载Python包，参考集群文档中关于Spack的说明配置本地Spack，或者联系管理员更新集群的公共Spack。
note
请注意，安装 Python 包需要集群连接到互联网，安装之前请使用 netlogin 工具登录校园网。
Q: 为什么我用module不能加载某个软件？
A: 可能有以下原因：
- 如果
module spider找不到，- 该软件/版本已经被删除，或者
- 索引未更新，请联系管理员解决；
- 如果
module spider能找到，但module avail找不到，- 该软件/版本有依赖，使用
module spider查看它的依赖，或者 - 该软件/版本属于Tcl旧模块，使用前需要先执行
$ module load showlegacy
- 该软件/版本有依赖，使用
- 如果
module avail能找到，但module load报错，该软件/版本配置有问题，请联系管理员解决。