实验室集群文档介绍了如何配置、使用 Spack。本文用具体的例子来演示如何在超算上配置 Spack，主要内容如下：

• 准备必要的数据
• 配置 Spack，修改配置文件
• 添加编译器和外部软件包
• 自定义软件包，安装软件包
• 导出模块文件
• 使用新安装的软件包

本文涉及的所有内容基本都包含在实验室集群文档和 Spack 官方文档中，因此不再专门给出链接。

使用实验室集群时，我们可能偶尔会遇到断开连接的情况，可能是主动断开SSH，也可能是网络不稳定。无论怎样，重新连接后不会自动恢复上一次的工作（所在的路径、环境变量、打开的文件等）。

为了保存工作，便于重连后继续，我们可以让自己的程序或者 shell 在后台一直运行。保持程序后台运行的方式/工具有很多，本文简单介绍以下几种：

• nohup 和 &
• screen
• tmux

本文演示了如何使用实验室集群上安装的BOUT++。

使用已安装的某版本BOUT++库：

$ spack load bout-dev ~openmp+scorep

使用BOUT++的依赖，但不包括BOUT++库本身：

$ spack load --only dependencies ~openmp+scorep

查看当前BOUT++的配置：

$ bout-config --all

Spack的环境变量、自动补全等都由Spack目录下的脚本设置。例如，为bash设置环境变量的命令为

$ export SPACK_ROOT=/path/to/spack
$ source $SPACK_ROOT/share/spack/setup-env.sh

当我们有多个Spack时，直接source其中一个Spack的环境配置脚本可能不会达到预期效果。比如，首先加载了集群的公共Spack，随后切换到自己的本地Spack，实际上仍有些环境是公共Spack设置的。此时我们需要清除一下旧的环境。

这里提供一些有用的参考资料, 主要是关于 Slurm 系统、Linux、DCU/GPU、编译调试相关的内容。
相关资料会不定期更新。

HPC 理论​

• Introduction to Parallel Computing

Slurm​

• SLURM调度器基础教程: 曙光先进计算
• Research Computing University of Colorado Boulder

Linux​

• Linux命令大全
• 鳥哥的 Linux 私房菜

调试​

• GDB to LLDB command map

编辑器​

• Vim 从入门到精通-中文
• Learn-Vim

相关链接​

• 上海交通大学 Pi 超算集群文档